Giulino affrontò il problema dell'intervento archivistico adottando il metodo di ordinamento cronologico, attraverso il quale la disposizione in ordine temporale dei documenti avrebbe consentito di rappresentare, in un lungo "continuum", lo svolgimento storico dell’ente.
Durante il riordinamento, atti sciolti e fascicoli furono sistemati in camice, riportanti la data e il titolo breve del contenuto. L’insieme di tutti i fascicoli così creati erano infine racchiusi in pacchi, uniti da due piatti di cartone, ai quali era assegnato un numero; quello anteriore recava la stampa della cornice sormontata dallo stemma della città di Novara, mentre all’interno Ercole guardava il lettore, seduto insieme a un leone adagiato sul numero di cartella.
Il riordinamento comportò necessariamente la realizzazione di uno strumento che consentisse di ritrovare la documentazione, organizzata in ordine rigorosamente cronologico e inserita in pacchi numerati. La corrispondenza tra i fascicoli e l’inventario era data dalla numerazione delle 280 cartelle, descritte in quattro volumi di inventario, dove venivano riportati analiticamente i regesti dei documenti. Un quinto volume conteneva una rubrica topografica.
Nella fase di riordino dell’archivio Giulino separò fisicamente i registri dalla documentazione sciolta. I primi vennero sistemati in 328 unità, numerate sul dorso di ogni registro, riordinate parzialmente in ordine cronologico senza tener conto della continuità delle serie.
Giulino non pose mano alla serie delle "Fedi di alloggiamenti e degli ordini militari", composta di carte tra il 1625 e il 1746, unite in pacchi con due piatti di cartone non decorati, recanti la sola indicazione dell’anno e del nome della serie.
Un successivo intervento sulle carte ordinate "ad annum" venne condotto dal liquidatore Antonio Peruchetti, che proseguì l'attività di inventariazione descrivendo le carte prodotte successivamente alla soppressione dell'organismo, tra il 1776 e il 1794.
L'archivio così composto pervenne a inizio Novecento nella disponibilità del Comune di Novara. Il 1° marzo 1972 venne formalizzata, tra l'ente locale e il costituendo Archivio di Stato della città, la consegna dell’archivio storico comunale, in esecuzione della convenzione stipulata il 4 agosto 1969. Il deposito riguardò anche archivi di provenienza statale; oltre a quelli dell’Intendenza per l’Alto e basso Novarese e Vigevanasco e della Prefettura napoleonica del Dipartimento dell’Agogna, vennero consegnati, a titolo di restituzione allo Stato, i fondi dei Contadi di Novara e di Vigevano.
A seguito del versamento, le unità sono state ricondizionate in buste nel rispetto dell'ordinamento di Giulino