Il 22 aprile 1243 il Cardinale Gregorio di Montelungo, Legato Pontificio, vendette Mortigliengo al Comune di Vercelli. La vendita restò senza effetto perché i Vescovi Eusebiani non ne riconobbero la validità.
Nel 1305-6 Mortigliengo fu ripetutamente saccheggiato dai dolciniani.
Dal 1351 al 1373, con altre parti del Biellese, passò sotto il dominio dei Visconti e dopo la rivolta di Biella contro il Vescovo Giovanni Fieschi, fece dedizione a Casa Savoia (31 ottobre 1379).
Il conte Amedeo VI Bona di Savoia, Amedeo VIII, Ludovico e la Duchessa Jolanda, con lettere patenti e sentenze del 1392, 1443, 1467, 1469 e 1473 riconobbero e confermarono gli antichi privilegi del mercato, macello, e dell'amministrazione della giustizia, per mezzo dei Consoli, sino al valore di un fiorino. Ma questi privilegi urtavano contro quelli di Biella. Perciò essa mosse lite a Mortigliengo ed ottenne nel 1469 da Amedeo VIII la proibizione a Mortigliengo di amministrare giustizia, di tener mercato e di macellare per vendere carne ai forestieri. In seguito a queste disposizioni gli agenti del Podestà di Biella si recavano in Mortigliengo per sequestrare le merci esposte nel mercato. Dopo circa 30 anni di contrasti, con istrumento 19 febbraio 1496 si addivenne a transazione che ebbe conferma dalla Duchessa Jolanda, con lettere patenti 4 marzo 1496. Con questa decisione Mortigliengo ebbe la facoltà di tenere due mercati settimanali, il lunedì davanti la chiesa parrocchiale, ed il mercoledì a Crosa mediante il pagamento di 25 lire di Savoia all'anno, da spendersi nella ricostruzione delle mura di Biella.
Negli anni 1512-13 si scoprirono casi di peste in Mortigliengo; fu in tale epoca che si deliberò di costruire presso la frazione Montaldo di Mezzana e sopra la punta di una collina, che è certamente il luogo più pittoresco di Mortigliengo, la chiesetta di San Rocco che nel 1526 fu dipinta da Daniele De-Bosis.
Nell'aprile del 1527 diversi cantoni di Mortigliengo furono saccheggiati e in parte incendiati dai soldati del conte Filippo Tornielli di Briona.
Il 3 marzo 1619, Carlo Emanuele I per ricompensare il suo gran cacciatore e gentiluomo di Camera, Giovanni Wilcardel de Fleury, Fresne e Sandreville della sua fedeltà e per gli atti di valore, erigeva in suo favore il Marchesato di Mortigliengo e Trivero.
Cento anni dopo quest'investitura che doveva essere perpetua, il Marchesato fu soppresso. Re Vittorio Amedeo II con l'editto del 1720 privava i Wilcardel dei feudi. Questi ritornati alla Corona, vennero suddivisi e venduti per il gran bisogno di denaro che aveva lo Stato, ad ambiziosi che li acquistavano per il titolo nobiliare.
Mortigliengo veniva così venduto col titolo di Conte per 7500 lire di Piemonte a Gian Giacomo di Giacomo Audifredi direttore generale delle R. Gabelle. Il suo pronipote, Pietro Luigi, morì celibe nel 1798 ed il feudo sarebbe passato alla nipote Gabriella, maritata a Carlo Rasini, se fosse stata chiesta l'investitura. Ma di certo pensarono che i tempi della feudalità erano per sempre tramontati; proprio in quell'anno, il 1° dicembre, sulla piazza della parrocchia di Mezzana in mezzo ad un'esplosione di entusiasmo si era innalzato l’albero della Libertà. I discendenti dei Rasini ne portarono però ugualmente il titolo.
Fin dal 1627 il Comune di Mortigliengo si era sciolto ed i suoi cinque cantoni o quartieri di Mezzana, Soprana, Casapinta Strona e Crosa si erano costituiti in Comuni autonomi.