L’organizzazione interna del Provveditorato era normata dal successivo decreto legislativo 37 del 27 giugno 1946, che integrava e modificava il precedente. In particolare l’articolo 3 stabiliva che l’istituzione in seno al Provveditorato di un ufficio amministrativo, di un ufficio tecnico e di un ufficio di ragioneria; l’articolo 5 istituiva un Comitato tecnico amministrativo, mentre l’articolo 9 prevedeva la costituzione di un servizio per i contratti da stipulare ai fini della realizzazione delle opere pubbliche.
Se l’ultimo articolo del decreto 16/1945 disponeva il proprio carattere temporaneo e dello stesso Provveditorato, legato alle immediate esigenze di ricostruzione bellica, tale disposizione fu presto superata dalle esigenze istituzionali e dalla prassi. Di ciò si ebbe una sanzione normativa soltanto col Decreto presidenziale 1534 del 1955 che abrogò il carattere temporaneo del Provveditorato, sancendone la sua competenza su scala regionale, la sua dipendenza dal Ministero dei lavori pubblici e i suoi ambiti di intervento.
L’azione del Provveditorato si intreccerà da subito con quella degli uffici del Genio civile con cui condividerà anche lo stesso destino di ulteriore decentramento; infatti il Decreto presidenziale 8 del 1972 disporrà, all’articolo 12, il trasferimento dei due enti alle dipendenze delle Regioni.