La gestione amministrativa delle truppe della piazza di Livorno e delle loro forniture era affidata al Commissariato di guerra che aveva sede a Livorno. Il Comando di piazza si occupava soprattutto di accogliere e addestrare le reclute che gli venivano assegnate, valutandone l'idoneità sul piano fisico prima di assegnarle ai singoli corpi secondo le istruzioni della Segreteria di guerra e, dal 1820, dal General comando supremo.
Il Comando poteva inoltre accettare o rifiutare i cambi proposti dalle comunità in sostituzione di alcuni arruolati, ed era suo compito riformare (cioè dichiarare non più arruolabili) quei militari che per motivi medici non potevano proseguire o rinnovare la ferma militare. Al comandante della piazza spettava inoltre la sorveglianza e la cura delle fortificazioni e degli edifici militari dove erano alloggiate le truppe.
Nel 1859, con l'istituzione del Regio Governo toscano, sotto il protettorato di Vittorio Emanuele II di Sardegna, iniziò una profonda opera di riforma delle strutture militari dell'ex-Granducato al fine di renderle omogenee con quelle del regno di Sardegna. Con regio decreto del 30 dicembre 1859 i Comandi militari delle piazze, diventati Comandi militari di compartimento, di circondario o di fortezza vennero estesi nelle funzioni e nelle zone di competenza.