Il testo unico delle leggi sulle acque ed impianti elettrici, approvato con r.d. 11 dic. 1933, n. 1775, attribuì ai tribunali delle acque pubbliche la denominazione di tribunali regionali delle acque pubbliche, riconfermando la loro giurisdizione territoriale (Titolo IV, Contenzioso, art. 138). Costituiti in sezione ordinaria delle corti di appello di ciascuna delle città sopraelencate, includevano nel collegio giudicante anche un funzionario del Genio civile. L'art. 139 del medesimo r.d. riconfermò il Tribunale superiore delle acque pubbliche con sede in Roma, nel Palazzo di giustizia, dotato di un proprio ufficio di cancelleria.
Secondo l'art. 140 i tribunali regionali giudicavano in primo grado su: controversie sulla demanialità delle acque; controversie circa i limiti dei corsi e bacini, alvei e sponde; controversie su qualunque diritto relativo alle derivazioni e utilizzazioni di acqua pubblica; controversie riguardanti l'occupazione totale o parziale, permanente o temporanea di fondi e le indennità previste in conseguenza dell'esecuzione o manutenzione di opere idrauliche, di bonifica e derivazione utilizzazione di acque; controversie per risarcimenti di danni dipendenti da opere eseguite dalla pubblica amministrazione e da qualunque provvedimento emesso dall'autorità amministrativa; ricorsi in materia di pesca. L'art. 141, invece, precisava che le azioni possessorie o di denuncia di nuova opera e danno temuto fossero proposte dinanzi al pretore competente per territorio, mentre per l'appello, l'azione fosse proposta al rispettivo Tribunale delle acque pubbliche.
L'art. 148 stabilì che le cancellerie delle sezioni di Corte di appello, designate a funzionare come tribunali regionali delle acque pubbliche, tenessero, oltre ai registri prescritti per la sezioni stesse dalle leggi vigenti, un foglio di udienza, un ruolo di udienza, un registro per deposito delle ordinanze e sentenze prescritte dall'articolo 183 e una rubrica dei fascicoli di causa. Dovevano essere tenuti i registri prescritti dagli articoli 34 e 35 del regolamento approvato con r.d. 10 dic. 1882, n. 1103, e quelli prescritti nell'articolo 41 del regolamento approvato con r.d. 7 ago. 1907, n. 611, indispensabili alle esigenze del servizio e indicati dal presidente. Tutti i registri, prima di essere utilizzati, dovevano essere numerati e vidimati in ciascun foglio dal presidente o da uno dei giudici da lui delegato.
L'art. 150 stabilì inoltre che tanto nel Tribunale superiore, quanto nei tribunali regionali delle acque pubbliche, gli originali delle sentenze fossero conservati in apposito volume; i processi verbali e gli altri atti di causa dovevano invece essere conservati in apposito fascicolo per ciascuna causa con relativo indice.
In base all'art. 64 del r.d. 30 gen. 1941, n. 12, il Tribunale regionale delle acque pubbliche era una Sezione specializzata della Corte di appello.
A seguito di due sentenze della Corte costituzionale del 2002 (17 luglio, n. 353, e 3 luglio, n. 305) il d.l. 11 nov. 2002, n. 251, stabilì la soppressione dei tribunali regionali e del Tribunale superiore delle acque pubbliche, con trasferimento di competenze in parte al Tribunale ordinario e in parte ai Tribunali amministrativi regionali (TAR). La legge di conversione, l. 10 gen. 2003, n. 1, non ha ratificato la parte in cui si disponeva tale soppressione e, pertanto i tribunali regionali delle acque pubbliche continuano ad operare.