Con legge 24 feb. 1809, n. 290, fu definita Amministrazione generale dei dazi indiretti per le dogane, i sali, i dazi di consumo e i diritti riuniti (art. 1). A livello territoriale furono previste: dieci Direzioni dipartimentali, due a Napoli ed una a Aquila, Bari, Chieti, Cosenza, Lecce, Manfredonia, Monteleone, Potenza (art. 23); cinque direzioni particolari, una per i dazi di consumo di Napoli e dei suoi casali, una per la provvista dei sali delle province di Napoli, di Terra di Lavoro e dei due Principati, una per la confezione dei sali nelle saline di Barletta, una per quelle di Avetrana in terra d'Otranto, una per lo scavo delle miniere dei sali nelle Calabrie (artt. 24-25 ). Le direzioni erano composte da due o più ispezioni e da distretti di percezione; i distretti da una ricevitoria e da un numero di sottoricevitorie proporzionato all'estensione del territorio (art. 27). I direttori che si avvalevano di "burò" (art. 29), vigilavano sulla percezione dei diritti doganali e sul rispetto della date di versamento degli introiti nelle casse dei ricevitori (art. 30).
Con il decreto 28 ott. 1810, n. 769, le competenze dell'Amministrazione furono ripartite in due rami distinti, per le dogane e i dazi di consumo, l'uno, e per i dritti riservati, l'altro. Con il successivo decreto 7 nov. 1810, n. 786, le direzioni dipartimentali, con compiti limitati al solo servizio delle dogane (artt. 1-2), si ridussero da dieci a sette e furono mantenute nelle seguenti sedi: due a Napoli, una a Chieti, Barletta, Taranto, Crotone, Monteleone.