Le istruzioni identificavano accanto ai subeconomi altre figure: il segretario del subeconomo, che svolgeva funzioni notarili, per la redazione dei documenti fondamentali (verbali di riduzione e presa di possesso, inventari, testimoniali di stato); il sopraintendente, che poteva coadiuvare il subeconomo nei distretti in cui questi aveva la cura di molte terre; l'economo temporale. Diverse erano le fattispecie previste: per i benefici pieni, subeconomo e sopraintendenti dovevano solo vigilare sulla buona conservazione di chiese, fabbriche, fondi coltivi e boschi. In caso di vacanza per morte del beneficiario, il subeconomo doveva curare la riduzione a mano regia e la presa di possesso del beneficio e sue pertinenze, con la descrizione dei beni e delle scritture; la redazione dell'inventario poteva seguire solo su ordine dell'Economato generale; la presa di possesso si faceva col rogito del segretario; era prevista la ricognizione di fabbriche e beni in contraddittorio degli eredi del beneficiario defunto; per il beneficio vacante era designato un economo temporaneo stipendiato, il quale doveva vigilare sui beni del beneficio, curandone la conservazione e le migliorie, ed esigendo le entrate; le locazioni potevano farsi solo dietro ordine dell'Economato; in caso di contestazioni con gli eredi del beneficiario defunto interveniva l'Economato generale; il subeconomo doveva tenere aggiornato un prospetto dei redditi e pesi di ciascun beneficio. Norme particolari regolavano per il nuovo beneficiario il placet e l'exequatur. Il placet al nuovo investito veniva dato su istanza dell'interessato, il quale doveva presentare i titoli (bolle, brevi, decreti, ecc.) all'Economato generale per l'exequatur. Il placet veniva unito all'istrumento di presa di possesso. Cardinali, arcivescovi, vescovi e prelati dovevano presentare i documenti direttamente al re. L'immissione in possesso veniva curata dal subeconomo (per i benefici di valore inferiore a lire 500 potevano provvedere direttamente i sovraintendenti). Le istruzioni stabilivano anche le tariffe da corrispondersi ai subeconomi, ponevano limiti per evitare abusi e prevedevano regole specifiche per i frutti, le scorte, le riparazioni, le locazioni.
Con patenti 4 gen. 1842, n. 366, venne stabilito che per la stipula di atti e contratti l'Economato godesse dei privilegi ed esenzioni in vigore per le regie aziende. Con editto 30 ott. 1847 furono devolute ai tribunali ordinari le controversie dell'Economato.
Con il r. d. 26 set. 1860, n. 4314, il regime dell'Economato e dei subeconomati fu esteso ai territori uniti al Regno di Sardegna, con alcune novità: cadeva la distinzione tra benefici maggiori e minori; si stabiliva il principio che i frutti dei benefici vacanti, detratte le spese, venissero applicati a migliorare la condizione di parroci e sacerdoti bisognosi e alle spese di culto e restauro delle chiese povere; l'amministrazione dei benefici vacanti testava affidata agli economi generali, di nomina regia, dipendenti dal ministro di giustizia; anche la nomina dei subeconomi nelle varie diocesi era di competenza del ministro di giustizia.
Questi criteri furono ulteriormente precisati dalla legge 16 gen. 1861, n. 4608, con cui si approvava un regolamento per i nuovi uffici; in esso era previsto che i subeconomi venissero nominati su proposta degli economi dal Ministro della giustizia.