Detta sede servì l’Istituto sino al trasferimento, il 30 marzo 2015, nella attuale nuova sede, di proprietà della Fondazione Cariverona, ubicata all’interno dell’area degli ex Magazzini Generali di Verona, oggetto di un programma di riqualificazione urbana tutt’ora in corso, che interessa una porzione urbana di 10 ettari, così come definita da Programma di Riqualificazione Urbana (PRUSST). La sede è anche annoverata tra le sedi monumentali degli Archivi di Stato italiani, nella recente monografia curata dal Ministero della Cultura.
Quando fu costruito nel 1926, l’edificio era denominato Magazzino 1, detto anche ‘del Grano’, in quanto costituiva uno dei centri di smistamento di derrate alimentari più importante d’Europa, al cui piano banchina trovavano posto undici celle frigorifere di varie dimensioni e la sala dedicata ai macchinari, costruiti dalla ditta Gaetano Barbieri & C. di Bologna, e composti da due gruppi motore asincrono con ognuno un compressore da 35 cavalli; limitrofa a questo locale vi era la cabina di trasformazione elettrica. Le celle erano affiancate da due lunghe gallerie nelle quali accedevano i vagoni ferroviari per le operazioni di carico e scarico. Il piano superiore, con ingresso tramite piani caricatori elettrici, era assegnato ai depositi delle merci nazionali e doganali. Al primo nucleo, denominato 1A, che occupava una superficie di 1.400 metri quadri, ne venne aggiunto un secondo, 1B, nei primi anni '30 e un terzo, 1C, verso lo stesso decennio.
L’edificio è sottoposto a vincoli emessi dal Ministero per i beni, le attività culturali ed il turismo, ed è stato oggetto di un intervento di restauro conservativo funzionale al collocamento dell’Archivio. Il fabbricato principale, che si eleva su 2 livelli, piano terra e primo piano, oltre a quelli ai piani ammezzati e interrati nord e sud, è costituito da un complesso di depositi archivistici di ultima generazione disposto due 2 livelli fuori terra composto da 24 depositi di armadi compattabili di cui 8 al piano terra nord, 9 al piano terra sud e 7 a piano primo nord con zone adiacenti dedicate a uffici e sala consultazione, oltre a spazi destinati a funzioni tecniche, tutti serviti da unità di trattamento aria (UTA) tecnologicamente avanzate. Ogni deposito è compartimentato REI, oltre ad essere dotato di porte tagliafuoco di sicurezza. All’interno è presente un sistema di armadi mobili scorrevoli su binario con movimentazione a leva (volano) che permette l’archiviazione totale di circa 50.000 metri lineari di documentazione. L’accesso agli utenti esterni è limitato alla zona visitatori, senza la possibilità di coabitazione con gli archivi e le aree “sensibili”.